Covid-19 : un nouveau variant découvert chez les rats dans les égouts de New-York, selon une étude américaine

Encore un nouveau variant découvert, dans les égouts de New-York cette fois-ci. Une étude menée par plusieurs universités américaines est parue dans la revue Nature, le 3 février 2022. 

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Pour surveiller la présence de nouveaux variants à New-York, les auteurs ont séquencé en profondeur les eaux usées des égouts de la ville. Un nouveau variant chez le rat a ainsi été découvert, comme le relate le média américain Syracuse. Des fréquences croissantes de nouvelles "lignées cryptiques" du virus, non reconnues dans les bases de données ont été observées. 

La preuve de la circulation chez les rats n'a pas encore été établie. Les auteurs expliquent que les rongeurs ont pu être infectés en buvant l'eau des égouts ou en mangeant des excréments.  

Pour les scientifiques, le prochain variant pourrait clairement émerger chez les rats dans un premier temps. L'étude conclut en expliquant que  "l'observation est cohérente avec la possibilité que ces lignées soient dérivées d'un hôte animal tel qu'un rongeur". 

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Ce n'est pas surprenant que de nombreux variants apparaissent. Lorsqu'un virus passe d'organisme en organisme, cela entraîne des modifications des gènes du virus. Il s'adapte alors toujours aux hôtes qu'il contamine : c'est une mutation. De fait, plus il se transmet, plus il y a de chances d'avoir des mutations. Pour devenir un variant, le virus doit connaître une vingtaine de mutations par rapport à la souche "originale" et se diffuser de manière massive.